Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TRABDQ9H4I3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRABDQ9H4I3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms