Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NXF3Q9H4D5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXF3Q9H4D5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms