Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCSER1Q9C0I3 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCSER1Q9C0I3 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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