Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHACTR1Q9C0D0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHACTR1Q9C0D0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHACTR1Q9C0D0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHACTR1Q9C0D0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHACTR1Q9C0D0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHACTR1Q9C0D0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHACTR1Q9C0D0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHACTR1Q9C0D0 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms