Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AMBRA1Q9C0C7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AMBRA1Q9C0C7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms