Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
TRIM15Q9C019 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRIM15Q9C019 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms