Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PUS3Q9BZE2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PUS3Q9BZE2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms