Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZC1

CELF4, CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4Q9BZC1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CELF4Q9BZC1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CELF4Q9BZC1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms