Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RSPO3Q9BXY4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RSPO3Q9BXY4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSPO3Q9BXY4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSPO3Q9BXY4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSPO3Q9BXY4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSPO3Q9BXY4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSPO3Q9BXY4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSPO3Q9BXY4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSPO3Q9BXY4 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSPO3Q9BXY4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RSPO3Q9BXY4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms