Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VN1R3Q9BXE9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VN1R3Q9BXE9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms