Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX40

LSM14B, Protein LSM14 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM14BQ9BX40 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LSM14BQ9BX40 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LSM14BQ9BX40 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.4 ms