Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVR0

HERC2P3, Putative HERC2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2P3Q9BVR0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HERC2P3Q9BVR0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HERC2P3Q9BVR0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms