Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C9orf16Q9BUW7 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C9orf16Q9BUW7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms