Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSY4

CHCHD5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD5Q9BSY4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CHCHD5Q9BSY4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CHCHD5Q9BSY4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms