Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TINF2Q9BSI4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TINF2Q9BSI4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TINF2Q9BSI4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms