Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM56Q9BRZ2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms