Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LARP6Q9BRS8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LARP6Q9BRS8 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LARP6Q9BRS8 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LARP6Q9BRS8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LARP6Q9BRS8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms