Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ39

DDX50, ATP-dependent RNA helicase DDX50, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX50Q9BQ39 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
DDX50Q9BQ39 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDX50Q9BQ39 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDX50Q9BQ39 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms