Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CITED2Q99967 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CITED2Q99967 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms