Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN18Q99952 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN18Q99952 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN18Q99952 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms