Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RBBP8Q99708 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RBBP8Q99708 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms