Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN18Q96SJ8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TSPAN18Q96SJ8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms