Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ODF3Q96PU9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ODF3Q96PU9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms