Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE6

ZIM3, Zinc finger imprinted 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIM3Q96PE6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ZIM3Q96PE6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ZIM3Q96PE6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms