Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
AGAP3Q96P47 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AGAP3Q96P47 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms