Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
C8orf49Q96NF6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C8orf49Q96NF6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms