Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
FAM20AQ96MK3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM20AQ96MK3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms