Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
NSMCE2Q96MF7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NSMCE2Q96MF7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms