Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
EP400Q96L91 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EP400Q96L91 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms