Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN2

CNDP1, Beta-Ala-His dipeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNDP1Q96KN2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CNDP1Q96KN2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CNDP1Q96KN2 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms