Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TPD52L3Q96J77 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TPD52L3Q96J77 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms