Protein–RNA interactions for Protein: Q96GR2

ACSBG1, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase ACSBG1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSBG1Q96GR2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ACSBG1Q96GR2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACSBG1Q96GR2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms