Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF2Q96GP6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF2Q96GP6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF2Q96GP6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF2Q96GP6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF2Q96GP6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF2Q96GP6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF2Q96GP6 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF2Q96GP6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SCARF2Q96GP6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCARF2Q96GP6 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCARF2Q96GP6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
SCARF2Q96GP6 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCARF2Q96GP6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SCARF2Q96GP6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SCARF2Q96GP6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms