Protein–RNA interactions for Protein: Q96F44

TRIM11, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM11, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM11Q96F44 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM11Q96F44 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM11Q96F44 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms