Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SMIM12Q96EX1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SMIM12Q96EX1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms