Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
MRPL53Q96EL3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MRPL53Q96EL3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms