Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO17Q96EF6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FBXO17Q96EF6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms