Protein–RNA interactions for Protein: Q96E22

NUS1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit NUS1, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUS1Q96E22 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NUS1Q96E22 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NUS1Q96E22 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms