Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ZNF501Q96CX3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ZNF501Q96CX3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms