Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FAM3DQ96BQ1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM3DQ96BQ1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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