Protein–RNA interactions for Protein: Q96A29

SLC35C1, GDP-fucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35C1Q96A29 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC35C1Q96A29 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SLC35C1Q96A29 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms