Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UTP4Q969X6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
UTP4Q969X6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms