Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNX21Q969T3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SNX21Q969T3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms