Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NKD2Q969F2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NKD2Q969F2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms