Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C6Q969F1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GTF3C6Q969F1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
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