Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP2A3Q93084 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP2A3Q93084 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP2A3Q93084 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms