Protein–RNA interactions for Protein: Q92932

PTPRN2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2Q92932 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPRN2Q92932 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTPRN2Q92932 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRN2Q92932 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRN2Q92932 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRN2Q92932 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTPRN2Q92932 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRN2Q92932 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRN2Q92932 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRN2Q92932 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRN2Q92932 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTPRN2Q92932 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms