Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ERCC4Q92889 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ERCC4Q92889 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms