Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
CTTNBP2Q8WZ74 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
CTTNBP2Q8WZ74 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CTTNBP2Q8WZ74 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms