Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUI4

HDAC7, Histone deacetylase 7, humanhuman

Predictions only

Length 952 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC7Q8WUI4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC7Q8WUI4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC7Q8WUI4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC7Q8WUI4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC7Q8WUI4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC7Q8WUI4 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC7Q8WUI4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDAC7Q8WUI4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDAC7Q8WUI4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDAC7Q8WUI4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms